病毒分离鉴定是直接检測病原，常需要配合免疫荧光技术，其用于诊断的最大优点是结果准确    (可靠，可以作为最后确诊，病毒分离应采集流产胎儿或死胎的肾、睾丸、肝、肺、肠系膜淋巴结或母猪胎盘、阴道分泌物（其中以肝及肠系膜淋巴结分离率最高），制成悬液，研磨制成1：5-1：10的乳剂，加双抗处理，接种到原代仔猪肾细胞或猪传代细胞单层上，培养16-36h后观察细胞核内包涵体，5 - lOd后观察特征性CPE（即细胞中出现弥散性颗粒，细胞变圆、丛集、固缩、崩解直至脱落），收毒后用血凝(HA)和血凝抑制(HI)试验或中和试验进行诊断鉴定。虽然此方法是最准确的诊断方法，但是费时费力，并且需要一定的技术条件和设备，另外，其检測结果常受到胎儿死亡时间的影响。