乙型脑炎可感染各种日龄、性别和品种的猪，一般呈散发型，多呈隐性感染。人工感染潜伏期一般为3-4d。猪感染后大多数突然发病，病猪体温突然升高达40-41℃，呈稽留热，精神沉郁，食欲减少，饮欲增加。结膜潮红，肠音减弱，粪便干燥，有时表面附着灰黄色或灰白色的黏液，尿呈深黄．  色。有的病猪后肢呈轻度麻痹，步行踉跄，关节肿大。有的病猪视力障碍，摆头，乱冲乱撞。最后后躯麻痹，倒地不起而死亡。、

母猪、妊娠新母猪感染乙脑病毒后，首先出现病毒血症，但无明显临床繁殖障碍症状。病毒随血流经胎盘侵入胎儿，致胎儿发病，而发生死胎、畸形胎或木乃伊胎，只有母猪流产或分娩时才发现症状。流产多在妊娠后期，流产胎儿，一一窝乳猪中通常都有不同数日的死胎、木乃伊胎，有神经系统症状的弱猪和外表正常的乳猪。