猪感染本病后，经过潜伏期，即可在蹄部等部位出现原发性水疱，水疱中的病毒造成局部细胞肿胀、坏死、崩解，并迅速通过细胞间传递而波及周鬧区域的众多细胞，继而造成更多的细胞水肿、坏死、崩解，产生继发性水疱。继发性水疱的破溃使上皮穿孔，形成破溃创面。病猪及破溃后的水疱液污染食物和环境，使易感猪感染，形成新的传染源，由此造成疾病的传播。蹄部皮肤是本病的主要靶器官，上皮病变的病理发生机理可分为两个过程：一是细胞死亡和由于皮肤棘细胞层松懈丧失了结合力；二是显著细胞内水肿导致上皮细胞的网状变性。具体过程：病毒侵入皮肤表皮细胞胞浆内，脱去衣壳，并以RNA为模板进行逆转录并大量复制和组装子代病毒粒子，病毒在细胞内增殖很快，使细胞物质代谢障碍并导致胞浆内细胞和微细胞结构破坏。细胞能量不足，氧化不全产物大量积聚，结果导致细胞内液积留和外液渗入，形成镜下可见的水疱。随着溶酶体的破坏和水解酶的释放，造成胞浆蛋白溶解，使整个细胞变成一个水疱，许多水疱变性的细胞融合在一起，从而形成肉眼可见的大小不一的水疱。