控制本病的重要措施是防止将病带到非疫区。不从疫区调入猪只和猪肉产品。运猪和饲料的交通工具应彻底消毒。屠宰的下脚料和泔水等要经煮沸后方可喂猪，猪舍内应保持清洁、干燥，平时加强饲养管理，减少应激，加强猪只的抗病力。

加强检疫、隔离、封锁制度：检疫时应做到两看（看食欲和跛行）、三查（查蹄、口、体温），隔离至少7天未发现本病，方可并入或调出，发现病猪就地处理，对其同群猪同时注射高免血清，并上报、封锁疫区。封锁一般于最后一头病猪恢复后20d才能解除，解除前应彻底消毒。

免疫预防：对疫区和受威胁区的猪可采取疫苗，接种的方法进行预防。我国目前制成的猪水疱病BEI灭活疫苗，平均保护率达96. 15%。免疫期5个月以上。对受威胁区和疫区定期预防能产生良好效果，对发病猪，可采用猪水疱病高免血清预防接种，剂量为每公斤体重O.I - 0.3mL保护率达90%以上。免疫期一个月。在商品猪中应用，可控制疫情，减少发病，避免大的损失。

常用消毒药：0.5%农福、0.5%菌毒敌、5%氨水、0.5%次氯酸钠等均有良好消毒效果。国外有人认为氧化剂、酸、去垢剂混合应用，碘化物、酸、去垢剂适当混和消毒也有效。对于畜舍消毒还可用高锰酸钾、去垢剂的混合液。

公共卫生学猪水疱病病毒与人的柯萨奇B5病毒密切相关，实验人员和饲养人员可因感染SVDV而得病，症状与柯萨奇B5病毒感染相似。近年来的研究表明，SVDV感染小鼠、猪和人后，都有不同程度的神经损害，因此，实验人员和饲养人员均应小心处理病毒和病猪，加强自身防护。