（一）临床综合诊断

本病有严格的季节性，呈散在性发生，多发生于初产母猪和10岁以下的儿童，有明显的脑炎症状，怀孕母猪发生流产，公猪发生睾丸炎，死后取大脑皮质、丘腑和海马角进行组织学检查，发现非化脓性脑炎变化等，可作为诊断的依据。

（二）病毒分离

在本病的流行初期，对怀疑因本病而流产或早产的胎儿，可采取存活仔猪吮乳前的血液，同时采取死产仔猪（病程不超过2-3d）的脑组织（大脑皮质、海马回、丘脑等），低温保存，一并送实验室进行确诊。）真将脑组织制成悬液后接种于鸡胚卵黄囊内或1～5日龄的乳鼠脑内，分离病毒。可分离到乙脑病毒，但分离率不高。

（三）血清学诊断

常采用血凝抑制试验、中和试验、补体结合试验等，但抗体在病初滴度较低，而且无法区分隐性感染或是免疫后产生的，故可采集急性期及恢复期双份血清进行抗体检测，抗体效价有4倍以上升高可作为诊断依据。此法只宜用于疾病回顾性诊断或流行病学调查，对早期诊断无太大价值。进行免疫抗体监测及流行病学调查时可采用乳胶凝聚试验、血凝抑制试验、酶联免疫吸附试验。

（四）免疫粘附血凝试验

当抗原—补体结合后，活化的C3b补体能与灵长类动物1人）红细胞表面的免疫粘附受体相结合，使红细胞发生凝集，基于此而建立了免疫粘附血凝试验。该试验可在试管或U型微量反应板上进行。在连续稀释的被检材料中加入乙脑免疫血清和补体，感作后加入红细胞，再经感作后，根据红细胞凝集像进行判定。感染鼠脑的检测敏感性达1：10 000以上。如抗原为乙脑病毒时，红细胞被吸附在细胞周围，形成花环状，即可判为阳性。用此法3-4h内可出结果。

（五）免疫酶组化染色

取脑脊液涂片或脑组织触片，经固定，除去内源酶，加乙脑抗体与辣根过氧化物酶结合物于涂（触）片上，使之与特异性抗原结合，经显色剂显色。在普通显微镜下观察有黄褐色着染即为阳性i，此法可在3～4h内得出明确结果。可用于血清中特异性抗体检测，进行流行病学调查。

（六）斑点金免疫渗滤测定法( DIGFA )

王祥等建立了一种以固相滤膜为载体，以红色胶体金颗粒标记的兔抗猪IgC作为探针，特异性地检测猪流行性乙型脑炎病毒抗体的斑点金免疫渗滤测定法(I)IGFA 。与血凝抑制试验(HI)对比检测了54份猪血清临床样本，两法的阳性符合率为71.4%、阴性符合率为65.5%、总符合率为81. 4%。本法中抗原抗体通过渗滤在膜上进行反应，数分钟内即可用肉眼观察结果，具有快速、操作简单、敏感性高、特异性强、重复性好、易于判读等优点，特别适合于猪流行性乙型脑炎快速诊断和大规模血清流行病学调查。

（七）聚合酶链式反应( PCR )

随着近年来分子生物学的发展，运用分子水平的检测技术进行诊断越来越普遍。该方法准确、快速、特异性高。。可以同时检测多种疾病，，张焕容等根据Genbank上已发表的猪伪狂犬病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)和猪流行性乙型脑炎病毒(JEV)基因序列，用ArrayDe-signer2.0软件设计并合成了PRVgB，PPVVP2，JEVC基因片段的3对引物，以PRVFa株、PPVB2株、JEVSA14 – 14 – 2株细胞培养物提取核酸混合物作为模板，筛选PCR反应条件，扩增出长度分别为324bp，471bp和238bp的3条特异性片段，建立了检测3种病毒的多重PCR方法。河北省保定市畜牧兽医部门Huang.C等建立了多重PCR技术用于猪伪狂犬、猪细小病毒和猪圆环病毒的诊断，可以检测到10- 4ng病毒核酸，该法能同时检测3种病毒的感染。